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Registros recuperados : 194 | |
1. | | CARVALHO, L. D. de; VIANA, E. de S.; OLIVEIRA, L. A. de; RITZINGER, R.; MAMEDE, M. E. de O. Caracterização física e físico-química de geléia convencional e dietética de umbu-cajá (Spondias Spp.). CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS, 22., 2010, Salvador. Potencialidades, desafios e inovações. Salvador : sbCTA, 2010. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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2. | | CARVALHO, P. C. L. de; RITZINGER, R.; SOARES FILHO, W. dos S.; LEDO, C. A. da S. Características morfológicas, físicas e químicas de frutos de populações de umbu-cajazeira no Estado da Bahia. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 30, n. 1, p. 140-147, mar. 2008. Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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4. | | COSTA, M. A. P. de C.; RITZINGER, R.; SOARES, D. M. L. B.; MACHADO, C. de F.; CUNHA, R. F. Divergência genética de acessos de acerola com base em marcadores RAPD. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). PDF 285. Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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5. | | CRUZ, E. S. da; MACHADO, C. de F.; RITZINGER, R.; MATOS, M. S. S.; SOUZA, V. de O.; LEDO, C. A. da S. Diversidade genética de aceroleiras (Malpighia Emarginata l.) com base em descritores morfoagronômicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil: [anais]. Búzios: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2011. 1 CD ROM. 4 p. Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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12. | | CRUZ, E. S. da; VIEIRA, R. S.; RITZINGER, R.; SOARES FILHO, W. dos S.; LEDO, C. A. da S. Características da inflorescência em umbu-cajazeira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). PDF 171 Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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13. | | DAMASCENO, J. C. A.; RITZINGER, C. H. S. P.; LUQUINE, L. S.; VIEIRA, R. S.; RITZINGER, R.; LEDO, C. A. da S.; SEVERINO, L. S. Resíduos orgânicos no desenvolvimento de mudas de mamoeiro infestadas pelo nematóide das galhas. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 457-459. Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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14. | | DAMASCENO, J. C. A.; RITZINGER, C. H. S. P.; LUQUINE, L. S.; VIEIRA, R. S.; RITZINGER, R.; LEDO, C. A. da S.; SEVERINO, L. S. Resíduos orgânicos no manejo de Meloidogyne incognita em mamoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 3., 2008, Salvador. Energia e ricinoquímica: resumos. Salvador: SEAGRI: Embrapa Algodão, 2008. p. 63 Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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15. | | DAMASCENO, J. C. A.; RITZINGER, C. H. S. P.; LUQUINE, L. S.; VIEIRA, R. S.; RITZINGER, R.; LEDO, C. A. da S.; SEVERINO, L. S. Resíduos orgânicos no manejo de Meloidogyne incognita em mamoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 3., 2008, Salvador. Energia e ricinoquímica: resumos. Salvador: SEAGRI: Embrapa Algodão, 2008. Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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16. | | DAMASCENO, J. C. A.; RITZINGER, C. H. S. P.; LUQUINE, L. S.; VIEIRA, R. S.; RITZINGER, R.; LEDO, C. A. da S.; SEVERINO, L. S. Resíduos orgânicos no manejo de Meloidogyne incognita em mamoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 3., 2008, Salvador. Energia e ricinoquímica: anais. Salvador: SEAGRI: Embrapa Algodão, 2008. 1 CD-ROM Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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17. | | DAMASCENO, J. C. A.; RITZINGER, C. H. S. P.; RITZINGER, R.; LEDO, C. A. da S.; SEVERINO, L. S.; CONCEIÇÃO, G. O.; BARBARA, M. F. S. Efeito de resíduos orgânicos em mudas de mamoeiro infestadas por Meloidogyne incognita. In: SIMPÓSIO BAIANO DE EDUCAÇÃO AMBIENTAL, 1., 2007, Cruz das Almas. Reciclando conceitos para desenvolver ações educativas com princípios ambientalistas. Cruz das Almas: [s.n.], [2007?]. Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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18. | | DAMASCENO, J. C. A.; RITZINGER, C. H. S. P.; RITZINGER, R.; VIEIRA, R. S.; LEDO, C. A. da S. Ação da manipueira no controle de nematóides em mudas de mamoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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19. | | FONSECA, N.; CARDOSO, M. M.; RITZINGER, R.; LONDE, L. C. N.; GONÇALOES, N. P.; SATURNINO, H. M. Propagação do umbuzeiro. Informe Agropecuário, Belo Horizonte, v 40, n. 307,p. 39-51, dez.,2019. Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Registros recuperados : 194 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul. |
Data corrente: |
15/02/2017 |
Data da última atualização: |
22/02/2017 |
Tipo da produção científica: |
Documentos |
Autoria: |
MUDADU, M. de A.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F. |
Afiliação: |
MAURÍCIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; HENRY GOMES DE CARVALHO, CPPSUL; MARCOS JUN ITI YOKOO, CPPSUL; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
Título: |
Imputação de genótipos em bovinos: um guia passo a passo. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa informática Agropecuária, 2016. |
Páginas: |
31 p. |
Descrição Física: |
il. |
Série: |
(Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 143). |
ISSN: |
1677-9274 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O programa de melhoramento genético no Brasil está implementando o uso de marcadores genéticos, um procedimento chamado seleção genômica (SG). SG consiste em genotipar uma população de referência com fenótipos conhecidos e na descoberta de marcadores genéticos associados. O efeito dos marcadores são estimados e validados de forma a tornar possível predizer os valores genéticos dos cadidatos à seleção baseado nos seus genótipos. A genotipagem de alta densidade tem custo elevado, de forma que usa-se genotipar a população de referência usando chips de alta densidade de marcadores e genotipar com menor custo os candidatos a seleção usando chips de baixa densidade de marcadores. A imputação de genótipos é então aplicada para expandir os dados de genotipagem dos candidatos, melhorando a intensidade de seleção e reduzindo custos. Nesse trabalho, três softwares de imputação, Beagle v4.1, Minimac v3 e Fimpute v2.2 foram usados para imputar genótipos de chips de baixa densidade para alta densidade, usando dados de genotipagem de 233 touros da raça Hereford e Bradford provindos da região sul do Brasil. Dados de alta densidade de genotipagem (777 mil marcadores) foram disponibilizados para todas as amostras, de forma que os dados de um chip de baixa densidade (50 mil marcadores) puderam ser obtidos e as acurácias dos softwares puderam ser medidas. Os resultados mostraram que os softwares permitiram imputar mais de 94% de todos os marcadores passíveis de imputação. A taxa de marcadores imputados corretamente variou de 86% a 94%. A performance dos softwares variou entre 26,9 a 378,1 marcadores imputados por segundo, usando uma amostra dos dados de genotipagem do cromossomo 1. De uma forma geral, todos os três softwares apresentaram boa performance e se mostraram como boas opções para a imputação de genótipos para se usar em SG MenosO programa de melhoramento genético no Brasil está implementando o uso de marcadores genéticos, um procedimento chamado seleção genômica (SG). SG consiste em genotipar uma população de referência com fenótipos conhecidos e na descoberta de marcadores genéticos associados. O efeito dos marcadores são estimados e validados de forma a tornar possível predizer os valores genéticos dos cadidatos à seleção baseado nos seus genótipos. A genotipagem de alta densidade tem custo elevado, de forma que usa-se genotipar a população de referência usando chips de alta densidade de marcadores e genotipar com menor custo os candidatos a seleção usando chips de baixa densidade de marcadores. A imputação de genótipos é então aplicada para expandir os dados de genotipagem dos candidatos, melhorando a intensidade de seleção e reduzindo custos. Nesse trabalho, três softwares de imputação, Beagle v4.1, Minimac v3 e Fimpute v2.2 foram usados para imputar genótipos de chips de baixa densidade para alta densidade, usando dados de genotipagem de 233 touros da raça Hereford e Bradford provindos da região sul do Brasil. Dados de alta densidade de genotipagem (777 mil marcadores) foram disponibilizados para todas as amostras, de forma que os dados de um chip de baixa densidade (50 mil marcadores) puderam ser obtidos e as acurácias dos softwares puderam ser medidas. Os resultados mostraram que os softwares permitiram imputar mais de 94% de todos os marcadores passíveis de imputação. A taxa de marcadores i... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Genotipagem em alta densidade; Imputação de genótipos. |
Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Genotyping. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155698/1/Doc143.pdf
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Marc: |
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